一个微生物处理微污染水体的案例是细菌催化过氧化物降解。在这种情况下，细菌可以利用过氧化物作为能量来降解含有污染物的水体中的有机废弃物。例如，一项关于使用微生物处理咸田县（日本）的小型污染水体的实证研究报告表明，当该县使用细菌催化过氧化降解方法处理小型海上废弃水时，可以将其中的大部分有害物质去除并将其水平降低到国家或地方法律法规所要求的标准。此外，在该方法中，通常不会出现交叉感染或危害人体健康的副作用。